介绍一款 MRI&CT 图像预处理强大工具--FSL

发布网友 发布时间：2024-10-24 09:34

我来回答

共1个回答

热心网友 时间：2024-11-06 07:44

全名是： F MRIB's S oftware L ibrary

具体地，可以分为以下4类功能

1 结构 MRI

2 . 功能 MRI

3 弥散 MRI

4 其他
前三个功能都是针对特定研究人群的，但是其他里面的小工具适合处理MRI,CT等图像，实用性非常强。

普通扫描的大脑图像包含非常多的组织，如图所示

从图上来看，操作也是非常简单，一句命令就搞定了。图片上有橘色和紫色区域就是提取出的脑组织。

上述中，我们只是把脑组织从图像里分割出来，更进一步，我们可以对脑实质进行分割，分割出白质（WM），灰质(GM)以及核团（CSF）。

该任务就相当于是对大脑组织进行三类分割。

这里就可以用到 FAST 功能。

配准功能也是非常强大，内置了很多个标准空间。

但是，无论是分割还是配准，都有局限性：只对 MRI 脑数据有作用,因为FSL 本身就是脑影像数据处理软件。

那我们不做 MRI 脑数据，这个工具还能干什么呢？

以下简单介绍一些通用功能：

该工具有点类似 PS 工具，可以叠加好几个图层进行显示。比如底层是原始图像，上面一层是分割结果。

该功能推荐程度：⭐️⭐️⭐️⭐️⭐️
以后会详细介绍FSLeyes的使用。这里做一个简单了解。

FSLUTILS 是一组有用的命令行实用程序，允许分析和 Nifti 格式数据集进行转换、处理等。可以同时处理 3D 和 4D 数据。对于这些程序中的每一个，只需键入程序名称即可获得使用帮助。

列举几个常用命令：

以上只是对 FSL 的一个简单介绍，FSL 常用工具的入门很容易。但是要使用 FSL 进行神经影像的分析会有难度。

如果想要更好的学习，提供以下几个链接，读者可自学。

如果你觉得这个功能实用，欢迎阅读下次安装教程~~

请持续关注，后续会详细介绍几个实用功能的用法，包括 FSLeyes, 脑组织分割，配准，Fslutils工具包常用功能。