单细胞联合bulk RNA-seq分析发现氧化应激基因多功能,疾病分型+预后模型...
发布网友
发布时间：2024-10-23 15:14
共1个回答
热心网友
时间：10小时前
在生信研究策略上，本文探讨了如何利用单细胞RNA测序(scRNAseq)和bulk RNA测序(RNA-seq)数据来研究AML中的氧化应激。首先，通过对比AML患者与健康对照的基因表达，识别出与氧化应激相关的基因，并通过功能注释和生物信息学分析揭示它们在AML细胞中的作用。研究者发现，这些基因与AML患者的预后和化疗反应存在关联，并建立了基于这些基因的预后模型，以及一个预测化疗敏感性的基因特征集。
具体分析中，研究者通过单细胞数据观察到化疗前后AML细胞和免疫细胞的变化，并发现化疗敏感性与氧化应激反应强度有关。在AML中，特别是AML-BC组，氧化应激相关基因集A显示出致癌和预后作用。同时，bulk RNA-seq数据也支持了这些发现，进一步证实了氧化应激在AML治疗反应中的预测价值。
文章总结，这项研究以氧化应激为核心，通过度分析，为AML的临床分型和预后评估提供了新的生物标记。对于寻求创新生信思路的科研人员，特别是对氧化应激方向感兴趣的人，番茄君提供了丰富的个性化和创新服务，包括免费评估、付费设计和定制化分析，帮助你在氧化应激研究领域中取得突破。
声明：本网页内容为用户发布，旨在传播知识，不代表本网认同其观点，若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
E-MAIL:11247931@qq.com
E-MAIL:11247931@qq.com