PBS缓冲液的配方

发布日期:2008-11-11 热门指数:865

PBS是最普遍不过的实验室缓冲液，但其配方各异。以下是我的总结： 母液的配制：

0.2M Na2HPO4：称取 71.6g Na2HPO4-12H2O，溶于 1000ml 水 0.2M NaH2PO4：称取 31.2g NaH2PO4-2H2O，溶于1000ml 水 各种浓度PB(pH=的配制：

先配 0.2M PB (pH=，100ml)：取19ml L的 NaH2PO4， 81ml L 的 Na2HPO4, 可。

然后 只需将0.2M PB (pH=按相应比例适当稀释 即可，如： 0.1M PB（PH=） ：取 500ml 0.2M PB，加水稀释至 1000ml 即可。 0.01M PB （PH=）：取50ml 0.2M PB，加水稀释至 1000ml 即可。 0.02M PB （PH=）：取100ml 0.2 M PB，加水稀释至 1000ml 即可。 若需要 NaCL 的话，加入 NaCL 至%（g/100ml）即可。 另：其它各种另 PH值的 0.2M PB（100ml)配方 ：

pH 0.2M NaH2PO4（ml） 0.2M Na2HPO4（ml）

92 8 90 10 85 15

即 51 49 45 55 38 62 33 67 28 72 23 77 19ml 81ml 16 84 13 87 7 93 分子生物学常用溶液配制

发布日期:2008-8-25 热门指数:3471 分子生物学常用溶液配制

一、分子生物学常用贮存液的配制

1．30%丙烯酰胺溶液

【配制方法】将29g丙烯酰胺和1g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之，补加水至终体积为100ml。用滤器（μm孔径）过滤除菌，查证该溶液的pH值应不大于，置棕色瓶中保存于室温。

【注意】丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收，其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒，但也应谨慎操作，因为它还可能会含有少量未聚合材料。

一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子，在丙烯酰胺贮存液中加入大约体积的单床混合树脂（MB-1Mallinckrodt），搅拌过夜，然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。

在贮存期间，丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。 2．40%丙烯酰胺

【配制方法】把380g丙烯酰胺（DNA测序级）和20g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理，但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。

【注意】见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。 3．放线菌素D溶液

【配制方法】把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中，1:10稀释贮存液，用100%乙醇作空白对照读取OD440值。放线菌素D（分子量为1255）纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21，900，故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为，放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中，保存于-20℃。

【注意】放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操

作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。 药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度，这类制品便可用于抑制自身引导作用。

4．L腺苷三磷酸（ATP）溶液

【配制方法】在水中溶解60mg ATP,用L NaOH调至pH值至，用蒸馏水定容1ml，分装成小份保存于-70℃ 5．10mol/L乙酸酰溶液

【配制方法】把770g乙酸酰溶解于800ml水中，加水定容至1L后过滤除菌。 6．10%过硫酸铵溶液

【配制方法】把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中，该溶液可在4℃保存数周。 7．BCIP溶液

【配制方法】把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐（BCIP）溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中，保存于4℃ 8．2×BES缓冲盐溶液

【配制方法】用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N，N-双（2-羟乙基）-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4，室温下用HCl调节该溶液的pH值至、然后加入蒸馏水定容至100ml，用μm滤器过滤除菌，分装成小份，保存于-20℃。

9．1mol/L CaCl2溶液

【配制方法】在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl26H2O，用μm滤器过滤除菌，分装

成10ml小份贮存于-20℃。

【注意】制备感受态细胞时，取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml，用Nalgene滤器（μm孔径）过滤除菌，然后骤冷至0℃。 10．L CaCl2溶液

【配制方法】在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl26H2O，用μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。 11．1mol/L二硫苏糖醇（DTT）溶液

【配制方法】用20ml L乙酸钠溶液（）溶解3.09g DTT，过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。

【注意】DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。 12．脱氧核苷三磷酸（dNTP）溶液

【配制方法】把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右，用微量移液器吸取l Tris碱分别调节每一dNTP溶液的pH值（用pH试纸检测），把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释，在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度，然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP，分装成小份贮存于-70℃。

碱基 波长（nm） 消化系数（ε）[L/（molcm）] A 259 ×104 G 253 ×104 C 271 ×103 T 260 ×103

比色杯光径为1cm时,吸光度=εM

13．l EDTA溶液

【配制方法】在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na2H2O），在磁力搅拌器上剧烈搅拌，用NaOH调节溶液的pH值至（约需20g NaOH颗粒）然后定容至1L，分装后高压灭菌备用。

【注意】EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近,才能完全溶解。 14．溴化乙锭（10mg/ml溶液）

【配制方法】在100ml水中加入1g溴化乙锭，磁力搅拌数小时以确保其完全溶解，然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中，保存于室温。

【注意】小心：溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性，使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套，称量染料时要戴面罩。 15．2×HEPES缓冲盐溶液

【配制方法】用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO42H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES，用l NaOH调节pH值至，再用蒸馏水定容至100ml。用μm滤器过滤除菌，分装成5ml小份，贮存于-20℃。 16．IPTG溶液

【配制方法】IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷（分子量为），在8ml蒸馏水中溶解2g IPTG后，用蒸馏水定容至10ml，用μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。

17．1mol/L乙酸镁溶液

【配制方法】在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁，用水定容至1L过滤除菌。 18．1mol/L MgCl2溶液

【配制方法】在800ml水中溶解203.4g MgCl26H2O，用水定容至1L，分装成小份

并高压灭菌备用。

【注意】MgCl2极易潮解，应选购小瓶（如100g）试剂，启用新瓶后勿长期存放。 19．β-巯基乙醇（BME）溶液

【配制方法】一般得到的是L溶液，应装在棕色瓶中保存于4℃。 【注意】BME或含有BME的溶液不能高压处理。 20．NBT溶液

【配制方法】把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。 21．酚/氯仿溶液

【配制方法】把酚和氯仿等体积混合后用L TrisHCl抽提几次以平衡这混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的l TrisHCl(pH=液层,保存于4℃。

【注意】酚腐蚀性很强，并可引起严重灼伤，操作时应戴手套及防护镜，穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗，并用肥皂和水洗涤，忌用乙醇。 22．10mmol/L苯甲基磺酰氟（PMSF）溶液

【配制方法】用异丙醇溶解PMSF成ml（10mmol/L），分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达ml的贮存液（100mmol/L）。

【注意】PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤，吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF，应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。

PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快，且25℃的失活速率高于4℃。pH值为时,20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min，这表明将PMSF溶液调

节为碱性（pH>）并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。 23．磷酸盐缓冲溶液（PBS）溶液

【配制方法】在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节溶液的pH值至加水定容至1L，在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。 24．1mol/L乙酸钾（pH=）溶液

【配制方法】将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中，用2mol/L乙酸调节pH值至后加入纯水定容到1L，保存于-20℃。 25．乙酸钾溶液（用于碱裂解）

【配制方法】在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入冰乙酸和水，即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。 26．3mol/L乙酸钠（和）溶液

【配制方法】在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠，用冰乙酸调节pH值至或用稀乙酸调节pH值至，加水定容到1L，分装后高压灭菌。 27．5mol/L NaCl溶液

【配制方法】在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L，分装后高压灭菌。 28．10%十二烷基硫酸钠（SDS）溶液

【配制方法】在900ml水中溶解100g电泳级SDS，加热至68℃助溶，加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至，加水定容至1L，分装备用。

【注意】SDS的微细晶粒易扩散，因此称量时要戴面罩，称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS，10%SDS溶液无须灭菌。 29．20×SSC溶液

【配制方法】在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠，加入数滴10mol/l NaOH溶液调节pH值至，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 30．20×SSPE溶液

【配制方法】在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4H2O和7.4g EDTA,用NaOH溶液调节pH值至（约需 10ml/L NaOH）,加水定容至1L,分装后高压灭菌。 31．100%三氯乙酸溶液

【配制方法】在装有500g TCA的瓶中加入227ml水，形成的溶液含有100%（M/V）TCA。

32．1mol/L Tris溶液

【配制方法】在800ml水中溶解121.91g Tris碱,加入浓HCl调节pH值至所需值。 pHHCl 70ml 60ml 42ml

应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 【注意】如1mol/L溶液呈现黄色，应予丢弃并置备质量更好的Tris。

尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值，但仍可向大多数厂商购得合适的电极。

Tris溶液的pH值因温度而异，温度每升高1℃，pH值大约降低个单位。例如：L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为、和。 33．Tris缓冲盐溶液（TBS）（25mmol/l Tris）

【配制方法】在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱，加入0.015g酚并用HCl调至pH值至，用蒸馏水定容至1L，分装后在151bf/in2×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min，于室温保存。 34．X-gal溶液

【配制方法】X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二甲基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中，装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏，并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。 二、常用抗生素溶液 抗生素 贮存液a 工作浓度

浓度 保存条件 严紧型质粒 松弛型质粒

氨苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 羧苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 氯霉素 34mg/ml(溶于乙醇) -20℃ 25μg/ml 170μg/ml 卡那霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml 链霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml 四环素b 5mg/ml(溶于乙醇) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml

a：以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。

b：镁离子是四环素的拮抗剂，四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基（如LB培养基）。

三、常用的电泳缓冲液

缓冲液 使用液 浓贮存液（每升）

Tris-乙酸（TAE） 1×：L Tris-乙酸 50×：242g Tris碱 L EDTA 冰乙酸 100ml L EDTA

Tris-磷酸（TPE） 1×:L Tris-磷酸 10×:10g Tris碱 L EDTA %磷酸（1.679g/ml） 40ml L EDTA

Tris-硼酸（TBE）a ×L Tris-硼酸 L EDTA 硼酸 20ml L EDTA

碱性缓冲液b 1×:50mmol/L NaOH 1×:5ml 10mol/L NaOH 1mmol/L EDTA 2ml L EDTA

Tris-甘氨酸c 1×:25mmol/L Tris 5×:15.1g Tris 250mmol/L 甘氨酸 94g 苷氨酸（电泳级）（） % SDS 50ml 10% SDS(电泳级) 实验室常用技术参数资料（二） 发布日期:2003-11-1 热门指数:6468 二、常用缓冲液

1．分子克隆常用缓冲液 2．磷酸缓冲液

（1）25℃下L磷酸钾缓冲液的配制※ pH 1mol/L K2HPO4(ml) 1mol/L KH2PO4(ml)

5×：54g Tris碱

（2）25℃下L磷酸钠缓冲液的配制※ pH 1mol/L Na2HPO4(ml) 1mol/L NaH2PO4(ml)

※:用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml，根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值： pH=pK’+1g([质子受体]/[质子供体]) 在此，pK’=(25℃)。 3．电泳缓冲液 测序凝胶加样缓冲液 98%去离子甲酰胺 10mol/L EDTA %二甲苯青FF %溴酚蓝

甲酰胺：许多批号的试剂级甲酰胺，其纯度符合使用要求，无须再进行处理。不过，一旦略呈黄色，则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理，并用Whatman 1号滤纸过滤2次，去离子甲酰胺分装成小份，充氮存于-70℃。 常用的电泳缓冲液

缓冲液 使用液 浓贮存液（每升）

Tris-乙酸（TAE） 1×：L Tris-乙酸 50×：242g Tris碱 L EDTA 冰乙酸 100ml L EDTA

Tris-磷酸（TPE） 1×:L Tris-磷酸 10×:10g Tris碱 L EDTA %磷酸（1.679g/ml） 40ml L EDTA

Tris-硼酸（TBE）a ×L Tris-硼酸 L EDTA 硼酸 20ml L EDTA

5×：54g Tris碱

碱性缓冲液b 1×:50mmol/L NaOH 1×:5ml 10mol/L NaOH 1mmol/L EDTA 2ml L EDTA

Tris-甘氨酸c 1×:25mmol/L Tris 5×:15.1g Tris 250mmol/L 甘氨酸 94g 苷氨酸（电泳级）（） % SDS 50ml 10% SDS(电泳级) 说明：

①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物，为避免这一问题，可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液，出现沉淀后则予以废弃。

以片都以1×TBE作为使用液（即1：5稀释浓贮液）进行琼脂糖凝胶电泳。但×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1：10稀释的贮存液作为使用液。

进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小， 故通过缓冲液的电流量通常较大，需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。 ②碱性电泳缓冲液应现用现配。

③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。 2×SDS凝胶加样缓冲液： 100mmol/L TrisHCl

200mmol/L二硫苏糖醇（DTT） 4%SDS（电泳级）

%溴酚蓝 20%甘油

不含DTT的2×SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温，应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。 4．凝胶加样缓冲液

缓冲液类型 6×缓冲液 贮存温度 Ⅰ %溴酚蓝 4℃

%二甲苯青FF

40%（W/V）蔗糖水溶液

Ⅱ 溴酚蓝 室温

%二甲苯青FF

15%聚蔗糖(Ficoll400)

Ⅲ %溴酚蓝 4℃

%二甲苯青FF 30%甘油水溶液

Ⅳ %溴酚蓝 4℃

40%(W/V)蔗糖水溶液

碱性加样缓冲液:

300mmol/L NaOH 6mmol/L EDTA

Ⅴ 18%聚蔗糖(Ficoll400) 4℃

%溴甲酚绿 %二甲苯青FF

使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三：增大样品密度；以确保DNA均匀进入样品孔内；使样品呈现颜色，从而使加样操作更为便利，含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的倍，而与琼脂糖浓度无关。以×TBF作电泳液时，溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同，而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为%～%的范围内，这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显着。

选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是，对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料，因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。 5．各种pH值的Tris缓冲液的配制 各种pH值的Tris缓冲液的配制 所需pH值（25℃） L HCl的体积 7．1 45．7 7．2 44．7 7．3 43．4 7．4 42．0

7．5 40．3 7．6 38．5 7．7 36．6 7．8 34．5 7．9 32．0 8．0 29．2

某一特定pH值的L Tris缓冲液的配制：将50ml L Tris碱溶液与上表所示相应体积（单位：ml）的L HCl混合，加水将体积调至100ml （2）温度对50mmol/L TrisHCl液pH值的影响 4℃ 25℃ 37℃ 8．1 7．5 7．2 8．2 7．6 7．3 8．3 7．7 7．4

8．4 7．8 7．5 8．5 7．9 7．6 8．6 8．0 7．7 8．7 8．1 7．8 8．8 8．2 7．9 8．9 8．3 8．0 9．0 8．4 8．1 9．1 8．5 8．2 9．2 8．6 8．3 9．3 8．7 8．4 9．4 8．8 8．5

（6）常用缓冲液的pKa值 缓冲液 分子量 pKa值 缓冲范围 Trisa HEPESb MPOSc PIPESd MESe

～ ～ ～ ～ ～

a：三羟甲基氨基甲烷；b：N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磷酸；c：3-（N-吗啉代）丙磺酸；d：N，N’-双（2-乙磺酸）哌嗪；e：2-（N-吗啉代）乙磺酸。 7．温度对常用缓冲液pH的影响 缓冲体系 pKa(20℃) △pKa/10℃

Mes Ada

PiPes Aces Bes

Mops Tes

Hepes

Tricine Tris Bicine

Glycylglycine

三、常用酶的配制 1．溶菌酶

用水配制成50mg/ml的溶菌酶溶液，分装成小份并保存于-20℃。每一小份一经使用后便予丢弃。 2．蛋白水解酶类

贮存液 贮存温度 反应浓度 反应缓冲液 温度 预处理 L Tris

链霉蛋白酶a 20mg/ml -20℃（溶于水） 1mg/ml L EDTA 37℃ 自消化b % SDS L Tris

蛋白酶Kc 20mg/ml -20℃（溶于水） 50μg/ml L EDTA 37～56℃ 无须预处理

% SDS

a：链霉蛋白酶是从链球菌（Streptomyces griseus）中分离到的一种丝氨酸酶和酸性蛋白酶的混合物。

b：自消化可消除DNA酶和RNA酶的污染，经自消化的链酶蛋白酶的配制方法如下：把该酶的粉末溶解于10mmol./l TrisHCl、10mmol/l NaCl中，配成20mg/ml浓度，于37℃温育1h。经消化的链霉蛋白酶分装成小份放在密封试管中，保存-20℃。

c：蛋白酶K是一种枯草蛋白酶类的高活性蛋白酶，从林伯氏白色念球菌（Tritirachium album Limber）中纯化得到。该酶有两个Ca2+结合位点，它们离酶的活性中心有一定距离，与催化机理并无直接关系。然而，如果从该酶中除去Ca2+，由于出现远程的结构变化，催化活性将丧失80%左右，但其剩余活性通常已足以降解在一般情况下污染酸制品的蛋白质。所以，蛋白酶K消化过程中通常加入EDTA（以抑制依赖于Mg2+的核酸酶的作用）。但是，如果要消化对蛋白酶K具有较强耐性的蛋白，如角蛋白一类，则可能需要使用含有1mmol/l Ca2+而不含EDTA的缓冲液。在消化完毕后、纯化核酸前要加入EGT（）至终浓度为2mmol/L,以鳌合Ca2+。

3．无DNA酶的RNA酶

将胰RNA酶（RNA酶A）溶于10mmol/l TrisHCl、15mmol/l NaCl中，配成10mg/ml的浓度，于100℃加热15min，缓慢冷却至室温，分装成小份保存于-20℃。 四、常用抗生素溶液

抗生素 贮存液a 工作浓度

浓度 保存条件 严紧型质粒 松弛型质粒

氨苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 羧苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 氯霉素 34mg/ml(溶于乙醇) -20℃ 25μg/ml 170μg/ml 卡那霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml 链霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml 四环素b 5mg/ml(溶于乙醇) -20℃ 10μg/ml 50μg/ml

a：以水为溶剂的抗生素贮存液通过μm滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。

b：镁离子是四环素的拮抗剂，四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基（如LB培养基）。

五、常用贮存液的配制 1．30%丙烯酰胺溶液 【配制方法】

将29g丙烯酰胺和1g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之，补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器（μm孔径）过滤除菌，查证该溶液的pH值应不大于，置棕色瓶中保存于室温。 【注意】

丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收，其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒，但也应谨慎操作，因为它还可能会含有少量未聚合材料。

一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子，在丙烯酰胺贮存液中加入大约体积的单床混合树脂（MB-1Mallinckrodt），搅拌过夜，然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。

在贮存期间，丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。 2．40%丙烯酰胺 【配制方法】

把380g丙烯酰胺（DNA测序级）和20g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理，但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。 【注意】

见上述配制30%丙烯酰胺的说明，40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。 3．放线菌素D溶液 【配制方法】

把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中，1：10稀释贮存液，用100%乙醇作空白对照读取OD440值。放线菌素D（分子量为1255）纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21，900，故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为，放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中，保存于-20℃。 【注意】

放线菌素D是致畸剂和致癌剂，配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作，而不能在开放在实验桌面上进行，谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。 药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度，这类制品便可用于

抑制自身引导作用。

4．L腺苷三磷酸（ATP）溶液 【配制方法】

在水中溶解60mg ATP,用L NaOH调至pH值至，用蒸馏水定容1ml，分装成小份保存于-70℃

5．10mol/L乙酸酰溶液 【配制方法】

把770g乙酸酰溶解于800ml水中，加水定容至1L后过滤除菌。 6．10%过硫酸铵溶液 【配制方法】

把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中，该溶液可在4℃保存数周。 7．BCIP溶液 【配制方法】

把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐（BCIP）溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中，保存于4℃ 8．2×BES缓冲盐溶液 【配制方法】

用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N，N-双（2-羟乙基）-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4，室温下用HCl调节 该溶液的pH值至、然后加入蒸馏水定容至100ml，用μm滤器过滤除菌，分装成小份，保存于-20℃。 9．1mol/L CaCl2溶液 【配制方法】

在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl26H2O，用μm滤器过滤除菌，分装成10ml小份贮存于-20℃。 【注意】

制备感受态细胞时，取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml，用Nalgene滤器（μm孔径）过滤除菌，然后骤冷至0℃。 10．L CaCl2溶液 【配制方法】

在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl26H2O，用μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。

11．1mol/L二硫苏糖醇（DTT）溶液 【配制方法】

用20ml L乙酸钠溶液（）溶解3.09g DTT，过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。 【注意】

DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。 12．脱氧核苷三磷酸（dNTP）溶液 【配制方法】

把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右，用微量移液器吸取l Tris碱分别调节 每一dNTP溶液的pH值（用pH试纸检测），把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释，在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度，然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP，分装成小份贮存于-70℃。 碱基 波长（nm） 消化系数（ε）[L/（molcm）]

A 259 ×104 G 253 ×104 C 271 ×103 T 260 ×103

比色杯光径为1cm时,吸光度=εM 13．l EDTA溶液 【配制方法】

在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na2H2O），在磁力搅拌器上剧烈搅拌，用NaOH调节 溶液的pH值至（约需20g NaOH颗粒）然后定容至1L，分装后高压灭菌备用。 【注意】

EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近，才能完全溶解。 14．溴化乙锭（10mg/ml溶液） 【配制方法】

在100ml水中加入1g溴化乙锭，磁力搅拌数小时以确保其完全溶解，然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中，保存于室温。 【注意】

小心：溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性，使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套，称量染料时要戴面罩。 15．2×HEPES缓冲盐溶液 【配制方法】

用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO42H2O、

0.2g葡聚糖和1gHEPES，用l NaOH调节 pH值至，再用蒸馏水定容至100ml。用μm滤器过滤除菌，分装成5ml小份，贮存于-20℃。 16．IPTG溶液 【配制方法】

IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷（分子量为），在8ml蒸馏水中溶解2g IPTG后，用蒸馏水定容至10ml，用μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。 17．1mol/L乙酸镁溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁，用水定容至1L过滤除菌。 18．1mol/L MgCl2溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解203.4g MgCl26H2O，用水定容至1L，分装成小份并高压灭菌备用。 【注意】

MgCl2极易潮解，应选购小瓶（如100g）试剂，启用新瓶后勿长期存放。 19．β-巯基乙醇（BME）溶液 【配制方法】

一般得到的是L溶液，应装在棕色瓶中保存于4℃。 【注意】

BME或含有BME的溶液不能高压处理。 20．NBT溶液 【配制方法】

把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中，保存于4℃。 21．酚/氯仿溶液 【配制方法】

把酚和氯仿等体积混合后用L TrisHCl抽提几次以平衡这一混合物，置棕色玻璃瓶中，上面覆盖等体积的l TrisHCl液层，保存于4℃。 【注意】

酚腐蚀性很强，并可引起严重灼伤，操作时应戴手套及防护镜，穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗，并用肥皂和水洗涤，忌用乙醇。

22．10mmol/L苯甲基磺酰氟（PMSF）溶液 【配制方法】

用异丙醇溶解PMSF成ml（10mmol/L），分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达ml的贮存液（100mmol/L）。 【注意】

PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤，吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF，应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。

PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快，且25℃的失活速率高于4℃。pH值为时，20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min，这表明将PMSF溶液调节 为碱性（pH>）并在室温放置数小时后，可安全地予以丢弃。 23．磷酸盐缓冲溶液（PBS）溶液

【配制方法】

在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节 溶液的pH值至加水定容至1L，在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。 24．1mol/L乙酸钾（）溶液 【配制方法】

将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中，用2mol/L乙酸调节 pH值至后加入纯水定容到1L，保存于-20℃。 25．乙酸钾溶液（用于碱裂解） 【配制方法】

在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入冰乙酸和水，即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。 26．3mol/L乙酸钠（和）溶液 【配制方法】

在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠，用冰乙酸调节 pH值至或用稀乙酸调节 pH值至，加水定容到1L，分装后高压灭菌。 27．5mol/L NaCl溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L，分装后高压灭菌。 28．10%十二烷基硫酸钠（SDS）溶液 【配制方法】

在900ml水中溶解100g电泳级SDS，加热至68℃助溶，加入几滴浓盐酸调节

溶液的pH值至，加水定容至1L，分装备用。 【注意】

SDS的微细晶粒易扩散，因此称量时要戴面罩，称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS，10%SDS溶液无须灭菌。 29．20×SSC溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠，加入数滴10mol/l NaOH溶液调节 pH值至，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 30．20×SSPE溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4H2O和7.4g EDTA，用NaOH溶液调节 pH值至（约需 10ml/L NaOH），加水定容至1L，分装后高压灭菌。 31．100%三氯乙酸溶液 【配制方法】

在装有500g TCA的瓶中加入227ml水，形成的溶液含有100%（M/V）TCA。 32．1mol/L Tris溶液 【配制方法】

在800ml水中溶解121.91g Tris碱，加入浓HCl调节 pH值至所需值。 pH HCl 70ml 60ml 42ml

应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 【注意】

如1mol/L溶液呈现黄色，应予丢弃并置备质量更好的Tris。

尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值，但仍可向大多数厂商购得合适的电极。

Tris溶液的pH值因温度而异，温度每升高1℃，pH值大约降低个单位。例如：L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为、和。 33．Tris缓冲盐溶液（TBS）（25mmol/l Tris） 【配制方法】

在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱，加入0.015g酚并用HCl调至pH值至，用蒸馏水定容至1L，分装后在151bf/in2×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min，于室温保存。 34．X-gal溶液 【配制方法】

X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中，装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏，并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。 杂交试验中用于降低背景的封闭剂 试剂 用途

Denhardt试剂 Northern杂交

使用RNA探针的杂交 单拷贝序列的Southern杂交

将DNA固定于尼龙膜上的杂交

Denhardt试剂通常配制50×贮存液，过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液（常为含有%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE）中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖（Ficoll,400型，Pharmacia）、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白（组分V”Sigmal），加水至终体积为500ml。 BLOTTO Grunstein-Hogness杂交

Benton-Davis杂交

除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交 斑点印迹

1×BLOTT（牛乳转移技术优化液，Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer）,是含5%胶脂奶粉和%叠氮钠的水溶液，应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用，因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求，可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂，因为这一封闭剂中可能含有RNA酶，其活性之高使人无法接受。

注意：叠氮钠有毒性，取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。 肝素 Southern杂交

原位杂交

肝素（Sigma H-7005，从猪中提取的二级产品或相当等级的产品）用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度，保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml，在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。

经变性并被打断的鲑精DNA southern和Northern杂交

把鲑鱼精子DNA（Sigma,Ⅲ,盐钠）溶解于水配制成10mg/ml的浓度，必要时于室温磁力搅拌2～4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至L，并用酚和酚/氯仿各抽提一次，回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次，以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水，配制成10mg/ml的浓度，测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度，然后煮沸10min，分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min，然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA 分子生物学实验基本数据

发布日期:2006-7-25 热门指数:2359 Units

1 mg = 10-3 g

1 ug = 10-6 g 1 ng = 10-9 g 1 pg = 10-12 g

1 kb of double stranded DNA = 660 kD

1 kb of single stranded DNA = 330 kD 1 kb of single stranded RNA = 340 kD

Average MW of a deoxynucleotide base = Daltons

Average MW of a deoxynucleotide base pair = 649 Daltons

1 ug/ml of DNA = uM phosphate

1 ug/ml of 1 kb of DNA = nM 5' ends

1 mol of pBR322 = x10+6 g.

1 pmol of linear pBR322, 5' ends = ug 1 A260 unit of duplex DNA = 50 ug

1 A260 unit of single-stranded DNA = 37 ug 1 A260 unit of single-stranded RNA = 50 ug

1 kb of DNA = 333 amino acids of coding capacity

= 37,000 daltons

Densities (50% GC):

RF I (supercoiled) ds DNA 1.709 g/ml RF II (nicked) ds DNA 1.54 g/ml ss DNA 1.726 g/ml ss RNA 1.90 g/ml protein 1.33 g/ml Formulas

DNA melting point: For duplex DNA >50 bp:

Tm = . C + log (M of NaCl) + (% GC) - [500/bp of shortest chain in duplex] - [(% formamide)] For duplex DNA <50 bp: Add 2deg. C for each A or T Add 4deg. C for each G or C

Picomoles of ends:

pmol ends per ug linear DNA = 3030/number of bases

DNA mobility in gels

Migration of marker dyes in native polyacrylamide non-denaturing gels

Gel % Bromophenol blue (BP) Xylene cyanole (XC)

100 460 65 260 45 160 20 70 12 45

Migration of marker dyes in polyacrylamide denaturing gels

Gel % Bromophenol blue (BP) Xylene cyanole (XC)

35 130 26 106 19 75 12 55 8 28

Relative positions of different DNA forms on Tris-acetate agarose gels

The exact distance between bands is influenced by percentage of agarose, time of electrophoresis, concentration of Ethidium bromide, degree of supercoiling and the size and complexity of the DNA. Amino acid symbols

Alanine Ala A Arginine Arg R Asparagine Asn N Aspartic acid

Asp D

Asparagine or Aspartic acid Asx B Cysteine Cys C Glutamine Gln Q Glutamic acid Glu E Glutamine or Glutamic acid Glx Z Glycine

Gly G

Histidine His H Isoleucine Ile I Leucine Leu L Lysine

Lys K

Methionine Met M Phenylalanine Phe F Proline Pro P Serine Ser S

Threonine

Thr T

Tryptophan Trp W Tyrosine Tyr Y Valine

Val V

Commonly used restriction enzymes and assay buffers

Enzyme Isoschizomers Buffer Temp Recognition Site Cloning sites Aat II med 37 GACGT/C Aat II Acc I med 37 GT/(AC)(GT)AC

Acc I, Cla I

Aha III Dra I med 37 TTT/AAA blunt Alu I med 37 AG/CT blunt Asu II 37 TT/CGAA Acc I, Cla I

Ava I med 37 C/YCGRG Sal I, Xho I, Xma I Ava II med 37 G/G(AT)CC Bal I low 37 TGG/CCA blunt

BamH1 med 37 G/GATCC BamH1, Bgl II Bgl I med 37 GCCN4/NGGC

Bgl II low 37 A/GATCT BamH1, Bgl II BstE II high 60 G/GTNACC BstN I low 55 CC/(AT)GG

Cla I low 37 AT/CGAT Acc I, Cla I Dra I Aha III low 37 TTT/AAA blunt EcoR1 high 37 G/AATTC EcoR1 EcoR1* low 37 /AATT EcoR1 EcoRV med 37 GAT/ATC blunt Hae I low 37 (AT)GG/CC(TA) Hae II low 37 RGCGC/Y

blunt

Hae III med 37 GG/CC blunt Hha I Cfo I, HinP1 med 37 GCG/C Hha I Hinc II med 37 GTY/RAC blunt

Hind III med 37-55 A/AGCTT Hind III Hinf I med 37 G/ANTC

HinP1 Cfo I, Hha I low 37 G/CGC Acc I, Cla I Hpa I low 37 GTT/AAC blunt Hpa II Msp I low 37 C/CGG Acc I, Cla I Kpn I low 37 GGTAC/C Kpn I

Mbo I Sau3A med 37 /GATC BamH1, Bgl II Msp I med 37 C/CGG Acc I, Cla I Mst I Fsp I high 37 TGC/GCA blunt Mst II Bsu36 I high 37 CC/TNAGG Nae I med 37 GCC/CCG blunt Nco I high 37 C/CATGG Nco I Nde I med 37 CA/TATG Nde I Not I high 37 GC/GGCCGC Nru I med 37 TCG/CGA blunt Pst I med 21-37 CTGCA/G Pst I Pvu I high 37 CGAT/CG Pvu I Pvu II med 37 CAG/CTG blunt Rsa I med 37 GT/AC blunt

Sac I Sst I low 37 GAGCT/C Sac I, Sst I Sal I high 37 G/TCGAC Ava I, Sal I, Xho I Sau3A I Mbo I med 37 /G*ATC BamH1, Bgl II Sfi I 50 GGCCN4/NGGCC

Sma I Xma I (1) 37 CCC/GGG blunt Sph I high 37 GCATG/C Sph I

Sst I Sac I med 37 GAGCT/C Sst I, Sac I Sst II Sac II med 37 CCGC/GG Sst II Taq I low 37-55 T/CGA AccI, Cla I Tha I FnuD II, Acc II low 37-60 CG/CG blunt Xba I high 37 T/CTAGA Xba I

Xho I Ccr I high 37 C/TCGAG Ava I, Cla I Xma I Sma I low 37 C/CCGGG Ava I, Xma I

Assay buffers (see enzyme vendors catalogs for additional information) 10x Low salt buffer

10x Core buffer

100mM Tris-HCl, pH 100mM MgCl2 10mM DTT

500mM NaCl

500mM Tris-HCl, pH

100mM MgCl2

10x Hind buffer

10x Medium salt buffer 500mM NaCl

600mM NaCl

100mM Tris-HCl, pH 70mM MgCl2

100mM Tris-HCl, pH 100mM MgCl2

10mM DTT

10x High salt buffer 1.0M NaCl

10x Sma I buffer (1)

200mM KCl

100mM Tris-HCl, pH 100mM MgCl2

500mM Tris-HCl, pH 100mM MgCl2 10mM DTT

10mM DTT

Heat inactivation of restriction enzymes

The following enzymes CAN be heat inactivated by incubation at 65 deg.

C for 10 min.: Alu I, Apa I, Ava II, Bal I, Bgl I, Cvn I, Dpn I, Dra I, Eco R II, Eco RV, Hae II, Hha I, Hinc II, Kpn I, Mbo I, Msp I, Nar I, Nde II, Rsa I, Sau 3a, Sca I, Sfi I, Spe I, Sph I, Ssp I, Sst I, Stu I, and Sty I.

The following enzymes are ONLY PARTIALLY heat inactivated by incubation

at 65 for 10 min.: Ava I, Cfo I, Cla I, Cvn I, Eco RI, Mbo II, Mlu I, Nci I, Nru I, Pst I, Pvu II, Sma I and Xma III

The following enzymes CANNOT be heat inactivated by incubation at 65

deg. C for 10 min.: Acc I, Bam HI, Bcl I, Bgl II, BstE II, Dde I, Hae III, Hind III, Hinf I, Hpa I, Hpa II Nde I, Nhe I, Nsi I, Pvu I, Sal I, Sau 96 I, Sst II, Taq I, Tha I, Xba I, Xho I, and Xor II. Oligonucleotide universal primers used for DNA sequencing M13 (-21) universal forward 5'-TGT-AAA-ACG-ACG-GCC-AGT-3' M13 (-40) universal forward 5'-GTT-TTC-CCA-GTC-ACG-AC-3'

M13/pUC reverse primer 5'-CAG-GAA-ACA-GCT-ATG-ACC-3' T7 primer 5'-TAA-TAC-GAC-TCA-CTA-TAG-GG-3' SP6 primer 5'-ATT-TAG-GTG-ACA-CTA-TAG-3' -16bs 5'-TCG-AGG-TCG-ACG-GTA-TCG-3' +19bs 5'-GCC-GCT-CTA-GAA-CTA-GTG-3' Listing of M13 (pUC) cloning sites

As they are read on DNA sequencing gels using the Universal primer: M13mp7

.......EcoR1......PstI..SalI..BamH1....EcoR1

GGCCAGTGAATTCCCCGGATCCGTCGACCTGCAGGTCGACGGATCCGGGGAATTC M13mp8

GGCCAGTGCCAAGCTTGGCTGCAGGTCGACGGATCCCCGGGAATTCGTAATCATG M13mp9

GGCCAGTGAATTCCCGGGGATCCGTCGACCTGCAGCCAAGCTTGGCGTAATCATG M13mp10

...HindIII..PstI..SalI..XbaI..BamH1..SmaI..SstI..EcoR1 GCCAAGCTTGGGCTGCAGGTCGACTCTAGAGGATCCCCGGGCGAGCTCGAATTCG M13mp11

...EcoR1..SstI..SmaI..BamH1..XbaI..SalI..PstI..HindIII GTGAATTCGAGCTCGCCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGG M13mp18 ..PstI..

AAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGAGGATCCCCGGGTACCGAGCTCGAATTC M13mp19

GAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTT 实验仪器名称中英文对照表

发布日期:2006-12-21 热门指数:5280

仪器中文名称 仪器英文名称 英文缩写

原子发射光谱仪 Atomic Emission Spectrometer AES

电感偶合等离子体发射光谱仪 Inductive Coupled Plasma Emission Spectrometer ICP

直流等离子体发射光谱仪 Direct Current Plasma Emission Spectrometer DCP

紫外-可见光分光光度计 UV-Visible Spectrophotometer UV-Vis

微波等离子体光谱仪 Microwave Inductive Plasma Emission Spectrometer MIP

原子吸收光谱仪 Atomic Absorption Spectroscopy AAS

原子荧光光谱仪 Atomic Fluorescence Spectroscopy AFS

傅里叶变换红外光谱仪 FT-IR Spectrometer

FTIR

傅里叶变换拉曼光谱仪 FT-Raman Spectrometer FTIR-Raman

气相色谱仪 Gas Chromatograph GC

高压/效液相色谱仪 Chromatography HPLC

离子色谱仪 Ion Chromatograph

凝胶渗透色谱仪 GPC

体积排阻色谱 SEC

X射线荧光光谱仪 XRF X

射线衍射仪 XRD

同位素X荧光光谱仪 Isotope X-Ray Fluorescence Spectrometer

电子能谱仪 Electron Energy Disperse Spectroscopy

能谱仪 EDS

质谱仪 MS

High Pressure/Performance Liquid Gel Permeation Chromatograph Size Exclusion Chromatograph X-Ray Fluorescence Spectrometer X-Ray Diffractomer

Energy Disperse Spectroscopy Mass Spectrometer ICP-质谱联用仪ICP-MS 气

相

色

谱

-质

谱

ICP-MS

联用仪 GC-MS

GC-MS 液

相

色

谱

-质

谱

联

用

仪

LC-MS

LC-MS

核磁共振波谱仪 NMR

电子顺磁共振波谱仪 Electron Paramagnetic Resonance Spectrometer ESR

极谱仪 Polarograph

伏安仪 Voltammerter

自动滴定仪 Automatic Titrator

电导仪 Conductivity Meter

pH计 pH Meter

水质分析仪 Water Test Kits

电泳仪 Electrophoresis System

表面科学 Surface Science

电子显微镜 Electro Microscopy

光学显微镜 Optical Microscopy

金相显微镜 Metallurgical Microscopy

扫描探针显微镜 Scanning Probe Microscopy

Nuclear Magnetic Resonance Spectrometer 表面分析仪 Surface Analyzer

无损检测仪 Instrument for Nondestructive Testing

物性分析 Physical Property Analysis

热分析仪 Thermal Analyzer

粘度计 Viscometer

流变仪 Rheometer

粒度分析仪 Particle Size Analyzer

热物理性能测定仪 Thermal Physical Property Tester

电性能测定仪 Electrical Property Tester

光学性能测定仪 Optical Property Tester

机械性能测定仪 Mechanical Property Tester

燃烧性能测定仪 Combustion Property Tester

老化性能测定仪 Aging Property Tester

生物技术分析 Biochemical analysis PCR仪 Instrument for Polymerase Chain Reaction PCR

DNA及蛋白质的测序和合成仪 Sequencers and Synthesizers for DNA and Protein

传感器 Sensors

其他 Other/Miscellaneous 流动分析与过程分析 Flow Analytical and Process Analytical Chemistry

气体分析 Gas Analysis

基本物理量测定 Basic Physics

样品处理 Sample Handling

金属/材料元素分析仪 Metal/material elemental analysis

环境成分分析仪 CHN Analysis

发酵罐 Fermenter

生物反应器 Bio-reactor

摇床 Shaker

离心机 Centrifuge

超声破碎仪 Ultrasonic Cell Disruptor

超低温冰箱 Ultra-low Temperature Freezer

恒温循环泵 Constant Temperature Circulator

超滤器 Ultrahigh Purity Filter

冻干机 Freeze Drying Equipment

部分收集器 Fraction Collector

氨基酸测序仪 Protein Sequencer

氨基酸组成分析仪 Amino Acid Analyzer

多肽合成仪 Peptide synthesizer

DNA测序仪 DNA Sequencers

DNA合成仪 DNA synthesizer

紫外观察灯 Ultraviolet Lamp

分子杂交仪 Hybridization Oven

PCR仪 PCR Amplifier

化学发光仪 Chemiluminescence Apparatus

紫外检测仪 Ultraviolet Detector

电泳 Electrophoresis

酶标仪 ELIASA

CO2培养箱 CO2 Incubators

倒置显微镜 Inverted Microscope

超净工作台 Bechtop

流式细胞仪 Flow Cytometer

微生物自动分析系统 Automatic Analyzer for Microbes

生化分析仪 Biochemical Analyzer

血气分析仪 Blood-gas Analyzer

电解质分析仪 Electrolytic Analyzer

尿液分析仪 Urine Analyzer

临床药物浓度仪 Analyzer for Clinic Medicine Concentration 血球计数器 Hematocyte Counter 核酸分子量、拷贝数计算方法

发布日期:2007-1-26 热门指数:1258 1A260 吸光度值=ds DNA50mg/ml =ss DNA33mg/ml =ss RNA40mg/ml

(OD260) x (dilution factor) x [33 或40或50]/ (1000) = mg/ml

MW = 克/摩尔

1 摩尔= x 1023 摩尔分子(拷贝数) 平均分子量:

dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基) ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基) ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基) 拷贝数计算公式:

x 10的23次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml. 例：3000 碱基质粒， 浓度100 ng/ml ， MW = 3000 bp x 660 dalton/bp = x 10的6次 daltons，1 mol = x 10的6次 g.

x 10的23次拷贝数/摩尔) x (1x 10的-7次克/微升) / x 10的6次 克/摩尔) = 3 x 10的10次 copies/ml.

oligo’s:(mg/ml) / MW x 10的6次 = mM 沉降系数测定

发布日期:2006-12-15 热门指数:819

沉降系数测定是分析离心机最主要的用途。通常只需要几十毫克甚至几十微克样品，配制成1~2毫升溶液，装入分析池，以几小时的分析离心，就可以获得一系列的样品离心沉降图。根据沉降图可以作样品所含组分的定性分析，亦可以测定各组分的沉降系数和估计分子大小，作样品纯度检定和不均一性测定，以组分的相对含量测定。 1.原理

沉降系数的测定原理就是在恒定的离心力场下测定样品颗粒的沉降速度。因

为样品颗粒很小，不能直接看到它们的沉降运动，所以把离心时样品颗粒的界面移动速度看作是样品颗粒的平均沉降速度。通常使用Schlieren和吸收光学系统来记录界面沉降图。在沉降图中样品界面一般表现为一个对称的峰，峰的最高点代表界面位置。通常沉降系数测量精度为±2%,但是如果面界图型表现为不对称峰型，或希 望沉降系数测量精度达到±1%或更小的情况时，按峰的最高点作为界面位置就不够了这时应该使用二阶距法计算界面位置。 2.沉降系数测定实例 ⑴样品：牛血清白蛋白

⑵样品溶液与离心：按%浓度将牛血清白蛋白溶于 NaCl、磷酸缓冲液中，。用12mm厚双槽分析池，一边加入溶液一边加入溶剂，约各。分析池与平衡池平衡重量，使平衡池比分析池轻以内，然后分别装入分析转头。分析转头装于分析离心为什么，关转动腔，抽真空。开 Schlieren光光源，选择工作速度一60000转/分，离心室温。转动腔达到真空后离以机开始运转加速，此时在观察窗口可以看到离心图型。达到工作速度后即为恒速离心。待看到样品峰的尖端后即可以6分 钟间隔照相，共照6张。照完相即可关机，取出样品液，清理转头和分析池。照相用强反差显影冲洗后即得Schlieren光路沉降图形照片。

⑶沉降图象测量：Schlieren沉降图可以用比长仪，读数显微镜，或投影仪测量。要求测量的横向量程为6cm，测量精度应优于10μm。通常读数显微镜已能满足要求。投影仪可以使图象放大于屏幕上，读测比较容易，眼睛不易疲劳。测量时把沉降图象的底片放于测量仪器上，使液面的垂直线与测量仪中的垂直线重合，然后用十字标线依次测量内参孔，液面，界面峰尖，和外参考孔的位置，每个图象至少读测三次，取平均值。依次把每个图象依同样方法测量，把数据列成表5。

照相号 x1(mm) x2(mm) x3(mm) x4(mm) (x3-x1)/a log[+(x3-x1)/a] 1 2 3 4 5 6

(4)沉降系数S的计算：沉降图测量完，先检查每一张图和第六张图的x2-x1值，二张图的x2-x1值的差应该小于界面峰位置的测量误差。实测x2-x1的差值为，说明液面在离心30分钟内变动为 。界面峰在30分钟内移动距离是第六号图的x1-x3减第一号图的x1-x3，是,其峰位测量意味着允许为。可内陆液面变动远小于峰位测量误差，说明离心时没有发生漏液。

按a=(x4-x1)/求算光路对分析池的放大倍数，然后按(x3-x1)/a求算界面峰离开内参考孔的实际距离，再按x=+(x3-x1)/a求算界面峰离开旋转中心的实际距离，再由对数表求算logx植，计算数据亦列于表5中。

3.离心图象的分析 当离心刚开始时如果见到有快速沉降的峰，几分钟内就到达分析池底部，一般多是由于样品发生部分聚合形成快速沉降的高聚物，如蛋白质样品液遇到某些变性因素时会部分变性而沉淀。离心达速后样品的的记心图象显示一个对称的峰形，一般可以认为样品是离心均一的。但是对样品的真正均一性还应用其他方法进一步检测，如电泳，层析等。某些混合样品偶然亦会给出一个对称峰的。峰形通常会随时间而扩展，这是由于样品扩散的结果。但如果峰形扩展很快，则该样

品可能是多分散性的。如果离心图象中表现几个峰，说明样品中有几个组分，每一个峰代表相应组分的沉降界面，因此可以测定每一个组分的沉降系数值。根据峰的面积可以测量组分的浓度值。

有时离心的图象表现出一个不对称的峰，这可能是由于下列几种情况所致。①几个沉降系数接近的组分峰形重叠，

②样品是多分散性的，其分子量分布不均匀，③某些相互作用强的高分子，其沉降速度对浓度依赖很大，如DNA，多糖分子，若测定于高浓度，在界面区由于浓度变化造成沉降速度不一致而致峰形呈不对称分布。这类样品在更大浓度时甚至会形成一非常尖锐的界面，在离心沉降图中表现成一根垂直线，看不到任何峰形。根据这种图形测定沉降系数误差将很大。通常这类样品应该测定于很稀的浓度，此条件下分子相互作用变小，界面扩展的峰形，才可以测到正确的沉降系数。 4.样品的纯度和浓度测定

分析离心机可以测定样品的纯度和浓度，这亦是分析离心用途。通常样品的离心图形表现一个对称峰形时，可认为该样品是离心均一的。但是在作纯度测定时还要注意样品的测定浓度，应该使样品测定浓度大于测定方法的灵敏度一百倍以上，测定才有意义。譬如Schlieren光路对该样品测定灵敏度为 ml，那么该样品测纯度时的浓度应该是90mg/ml。假如选用样1mg/ml浓度测定，沉降图形即使表现单一峰，仍不能确定其纯度是0%还是99%。如果样品是多组分的，离心图中表现几个峰，根据每个峰的面积与所有峰的总面积的比值可以得到每个组分的相对浓度值。在计算时应该考虑辐射稀释效应，即把各个组分的面积值根据其所在位置用辐射稀释公式校正到液面处的值，然后计算相对。还要注意这样的浓度估测是建立在各个组分具有相同的折射率比值的假设基础上的。根据峰形面积结合

该组分的浓度与折射率比值和仪器常数还可以计算该组扫的绝对浓度值。 5.带状沉降法

带状沉降法类似于速率区带离心法。方法使用合成界面池，在池中预先加入的1M NaCl溶液，然后地2000转／分转速下铺上样品液，然后加速到30000转／分，用吸收光路记录样品沉降图形。由于NaNl向样，品带扩散形成一密度梯度区，可以稳定沉降的样品区带。样品中如果有多个沉降系数不同的组分，它们将依各自的沉降速度呈区带沉降。利用这个方法可以检定样品纯度，估测组成的相对含量和沉降系数。适用于微量的核酸和病毒样品的分析测定。 生命科学常用数据库

发布日期:2006-12-6 热门指数:1048

蔗糖水溶液的密度 g/mL

发布日期:2006-11-27 热门指数:709

蔗糖水溶液的密度 g/mL ( 摘自 : \"Principles of Sugar Technology\" , p31 ) 克蔗糖/100克溶液 0℃ 10℃ 15℃ 20℃ 25℃ 30℃ 40℃ 50℃ 60℃ 0 5 10 15 20 25 30 35

40 45 50 55 60 65 70

蔗糖水溶液的密度 g/mL ( 摘自克蔗糖/100克溶液 0℃ 10℃ 15℃ 20℃ 25℃ 30℃ 40℃ 50℃ 60℃ 0

: \"Principles of Sugar Technology\" , p31 ) 5 10

15 20

25 30

35 40 45

50 55

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蔗糖水溶液的密度 g/mL ( 摘自克蔗糖/100克溶液 0℃ 10℃ 15℃ 20℃ 25℃ 30℃ 40℃

: \"Principles of Sugar Technology\" , p31 ) 50℃ 60℃ 0 5

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常见蛋白质的等电点

发布日期:2006-11-16 热门指数:1443

常见蛋白质等电点参考值 蛋白质 等电点 鲑精蛋白[salmine] 鲱精蛋白[clupeine] 鲟精蛋白[sturline] 胸腺组蛋白[thymohistone] 珠蛋白（人）[globin(human)] 卵白蛋白[ovalbuin] ； 伴清蛋白[conal bumin] ， 血清白蛋白[serum albumin] － 肌清蛋白[myoal bumin] 肌浆蛋白[myogen A]

β-乳球蛋白[β-lactoglobulin] － 卵黄蛋白[livetin] －

γ1—球蛋白（人）[γ1-globulin(human)] γ2—球蛋白（人）[γ2-globulin(human)] 肌球蛋白A[myosin A] 原肌球蛋白[myosin A] 铁传递蛋白[siderophilin] － 胎球蛋白[fetuin] － 血纤蛋白原[fibrinogen] α-眼晶体蛋白[α-crystallin]

，， ， －β-眼晶体蛋白[β-crystallin] 花生球蛋白[arachin]

伴花生球蛋白[conarrachin] － 角蛋白类[keratins] － 还原角蛋白[keratein] － 胶原蛋白[collagen] － 鱼胶[ichthyocol] － 白明胶[gelatin] － α-酷蛋白[α-casein] β-酷蛋白[β-casein] － γ-酷蛋白[γ-casein] － α-卵清粘蛋白[α-ovomucoid] － α1-粘蛋白[α1-mucoprotein] 卵黄类粘蛋白[vitellomucoid] － 尿促性腺激素[urinary gonadotropin] － 溶菌酶[lyso zyme] 肌红蛋白[myoglobin]

血红蛋白（人）[hemoglobin(human)] 血红蛋白（鸡）[hemoglobin(hen)] 血红蛋白（马）[hemoglobin(horse)] － 血蓝蛋白[hemerythrin]

蚯蚓血红蛋白[chlorocruorin] －

血绿蛋白[chlorocruorin] －

无脊椎血红蛋白[erythrocruorins] － 细胞色素C[cytochrome C] － 视紫质[rhodopsin]

促凝血酶原激酶[thromboplastin] α1-脂蛋白[α1-lipoprotein] β1-脂蛋白[β1-lipoprotein] β-卵黄脂磷蛋白[β-lipovitellin] 芜菁黄花病毒[turnip yellow vvirus] 牛痘病毒[vaccinia virus] 生长激素[somatotropin] 催乳激素[prolactin] 胰岛素[insulin] 胃蛋白酶[pepsin]

糜蛋白酶（胰凝乳蛋白酶[chymotrypsin] 牛血清白蛋白[bovine serum albumin]

核糖核酸酶（牛胰）[ribonuclease或Rnase(bovine pancreas)] 甲状腺球蛋白[thyroglobulin] 4 常用生物软件（windows）全面介绍 发布日期:2006-11-19 热门指数:1600 常用生物软件（windows)全面介绍 一、基因芯片

1、基因芯片综合分析软件。

ArrayVision 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。

Arraypro Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。

phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境后后，才能运行。 2、 基因芯片阅读图像分析软件

ScanAlyze ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。

3、 基因芯片数据分析软件

Cluster 斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster）分析与其它各种处理的软件。

SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显着性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示

TreeView 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。

FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计

Array Designer DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具

二、RNA二级结构

RNA Structure RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。 基本配置：Windows95,Windows98或WindowsNT。Pentium以上芯片，32兆内存。 RNAdraw 是一个进行RNA二级结构计算的软件。 1. 它 是Windows下的多文档窗口 (multipledocument interface) 软件，允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。2. RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。3. RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。

loopDloop Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。 Circles Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。 三、序列综合分析

Vector NTI Suite 不喜欢装备各种专业性强的软件，而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的数据库管理（增加、修改、查找），对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中进行选定（数据）->分析->结果（显示、保存和入库）三步完成。在分析主界面，软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作，生成重组分子策略和实验方法，进行限制酶片段的虚拟电泳，新建输入各种格式的分子数据、加以注释，输出高质量的图像。Vector NTI Suite还有以下独立的分析程序，完成相关分析。这些独立的程序，可以通过选定->分析->结果三步调用。 l 3DMol－显示PDB格式分子的三维结构 l Align X－序列相似性比较

l Align Xblocks－序列局部完全相同比较 l ContigExpress－将小片段拼装成长序列 l GCGConverter－GCG格式文件转换成NTI的格式 l PubMed/Entrez Search－搜索PubMed、PDB、GenBank l Back Translation－核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具 l Matrix Editor－矩阵数据编辑

l Tools Manager－连接其他程序和网络连接的界面。分成Align、Analyze、Assemble、Tools四部分。

即着名的Lasergene Suite，由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块组成，该软件的MegAlign模块，可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示，并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DNAstar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件，可见其功能强大。

Omiga 实际上，大部分对核酸蛋白的序列分析功能，在Omiga 中都能找到；而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件，它还兼有引物设计的功能。主要功能：编辑、浏览、蛋白质或核酸序列，分析序列组成。用Clustal. W进行同源序列比较，发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化，序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为RNA链，以不同的读码框、遗传密码标准翻译成蛋白质序列。查找核酸限制性酶切位点、基元（Motif）及开放阅读框（ORF），设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点（Proteolytic Sites）、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示，表格设有多种分类显示形式。利用Mange快捷键，用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数，可供选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外，该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析，对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。

DS gene : Omiga 的换代产品，accelrys公司Discovery studio系列，accelrys公司的insight II,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件，DS gene 是GCG的个人机简版，功能强大，而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vector NTI

的界面影响，DS gene 与Omiga 相比界面有了很大的改变。

DNASIS for Windows 版是日立软件公司（Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.）97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能，可进行DNA，RNA，蛋白质序列的编辑和分析，甚至还能进行质粒作图、数据库查询等功能，足可满足一般实验室的要求。在DOS时代，DNASIS 7等版本便是流传甚广并曾给过许多人以帮助的分子生物学软件，因此我们有理由期待Win版的DNASIS 会带给我们惊喜。 DNASIS MAX DNASIS 的更新换代产品。综合序列分析软件，体积比上一个版本一下膨胀了许多。界面风格也改变了很多。 DNATools 与Omiga, DNAsis, PCgene等软件属于同一类的综合性软件,操作简单功能多。DNATools设计的用户友好、强壮，以便快速、方便地获取、贮藏和分析序列及数据库查询获得的序列相关信息。DNATools包容性很好，能把几乎所有文本文件打开作为序列。当程序不能辨别序列的格式时（通过寻找常用序列格式的特征），会显示这个文件的文本形式，以便你编辑生成正确的蛋白质或DNA序列，编辑后可以再被载入程序。若你的序列是DNATools格式时（DNA或寡核苷酸序列），程序不加注解的载入序列，程序模式调整成可以接受载入的数据类型（蛋白质、DNA和寡核苷酸引物序列）。在一个项目中可以加入几千个序列或引物，并在整个项目中分析这些序列及标题。这个程序的一个特点是给每个序列或引物添加文本标题。这样就可以用自定义的标题识别序列，而不必通过它们的文件名。 Bioedit一个具有序列简单分析和序列对比功能的软件。该软件有一个简单亲切的界面，集成其他已经很有效果的序列比对软件。另外该软件还有很多有用的相关站点连接。虽然该软件看起来结构简单，但却又很强的可充性，可以自由整合许多软件，例如viewtree.

Jellyfish 只水母不简单，可以用来进行DNA翻译，序列排队比较，限制酶消化，提交序列进行BLAST，研究项目管理等。操作十分简单，只需拖动与点击便可。 Genetools Genebio公司的核酸序列分析软件，虽然不及vect NTI 和DS gene 强大，它具有repeat /vect find 使其他分析软件所不具有的，值得一提的是该软件具有的CpG island分析。

DNAMAN 限制酶分析，引物设计，对排（aligment）,翻译，数据库操作，Blast，序列装配（Sequence assembly）.易学易用，操作方便。 四、限制酶切位点分析

大多软件只对线性序列进行分析，那么***NNN…NNNgaatt环状的序列就找不到EcoR I的位点。DNAssist 能很容易把这个EcoR I位点找出来。另外DNAssist在输出上非常完美，除了图形、线性显示外，还有类似DNASIS的列表方式，列出有的位点（按酶排列，按碱基顺序排列）。 五、质粒绘图

Gene Construction Kit 这一个非常好的质粒构建软件包。与大多数分析的软件不同，它制作并显示克隆策略中的分子构建过程；包括质粒构建，模拟电泳条带；当然还可以质粒作图（有无序列均可）。通过它绘出来的图还可以继续用来构建克隆策略图谱。只是该软件由于功能太强，使用起来也不简单；幸亏它附有详细的使用帮助，认真研究后，应该没有问题。

Winplas 该软件用来绘制发表质量的质粒图，可广泛应用与论文、教材的质粒插图。其特性包括：1.知道序列或不知序列结构均能绘制质粒图；2. 可读入各种流行序列格式文件引入序列信息；3. 自动识别限制位点 可构建序列结构，功能包括：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等；4. 绘图功能强大，

功能包括：位点标签说明、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形序列绘制、可输出到剪贴板、可输出到图像文件；5. 限制酶消化分析报告输出与序列输入报告功能。

Plasmid 是由加拿大的Premier Biosoft公司推出的用于质粒作图的专业软件，主要用于进行质粒作图，质粒特征分析和质粒设计。其主要界面分为序列编辑窗口（Genetank），质粒作图窗口（Plasmid Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）。打开程序就可进入序列编辑窗口，可以直接打开Genbank或Vector数据库中已知质粒的序列文件，将序列读入，并将有关于质粒的各种特征，包括编码区，启动子，多克隆位点以及参考文献等信息保存在Header中；也可以直接输入序列进行未知质粒的设计。

Redasoft Visual Cloning 2000 用来帮助生命科学家快速而轻松地绘制专业级质量的质粒载体图， 主要的性能包括：快速和轻松地生成一个清晰，色彩鲜明的环行或线性的载体图。自动识别和解析序列文件。新增的web浏览功能允许你链接到数据库站点，并支持下载和自动将序列文件转换成载体图。强大的限制性内切酶分析功能和拥有将近1000种来自REBASE的限制性内切酶。片段的删除和插入完全模拟克隆实验并和其他图形兼容。所看即所得 (What You See Is What You Get)的编辑环境使得你的打印结果和你在屏幕上看到的保持一致。自动标记各种区段的碱基位置以避免重叠。可选择的图形比例尺使几个构造图间很容易比较。允许质粒图拷贝到剪贴板并粘贴到其他Windows应用程序。可以用e-mail的方式传递载体图。

SimVector 质粒图绘制软件，绘制发表质量的质粒图与序列、载体图。 Clone Manager 小巧的研究人员日常使用的辅助克隆工具，主要功能是限制酶切

割、分子重组、质粒作图等。 六、引物分析

Primer Premier 顾名思义，该软件就是用来进行引物设计的。可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物，而在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来。而且进行这些操作非常简单 Oligo 引物分析着名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件，同时计算核酸序列的杂交温度（Tm）和理论预测序列二级结构。

Primer D＇Signer 免费的引物设计辅助软件，专门用于pASK-IBA和pPR-IBA表达载体，简化引物设计工作。

Array Designer DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具

Beacon Designer PCR定量分析分子信标(Molecular beacon )设计软件 NetPrimer 于WEB界面的引物设计程序，，包括JAVA程序和帮助文件，解压后，可在本地直接使用，不须再连到原始网站使用。 七、蛋白二级结构分析

ANTHEPROT 是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。应用此软件包，使用个人电脑，便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。更重要的是该软件能够提供蛋白序列的一些二级结构信息，使用户有可能模拟出未知蛋白的高级结构。 Peptool, 与genetool同出一家，可以进行氨基酸序列的二级结构预测，motif

的寻找，酶切片断的分析，以及转录后的甲基化分析。是为数不多的蛋白分析软件。

VHMPT （Viewer and editor for Helical Membrane Protein Topologies）是螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件，可以自动生成带有跨膜螺旋的蛋白的示意性2维拓扑结构，并可对拓扑结构进行交互编辑。由**生物医学科学研究所的黄明经博士编制。安装Tcl 方可运行。

MACAW 序列构建与分析工作台软件(Multiple Alignment Construction & Analysis Workbench, MACAW)是一个用来构建与分析多序列片段的交互式软件。MACAW具有几个特点： 1. 新的搜索算法查寻类似区，消除了先前技术的许多限制。 2. 应用一个最近发展的数学原理计算block类似性的统计学显着性。 3. 使用各种视图工具，可以评估一个候选block包含在一个多序列中的可能性。 4． 可以很容易地编辑每一个block。 八、凝胶分析软件

BandScan 通用的电泳胶条带定量分析软件，手动、自动找到条带，手动的条带可以是无规则的，可以清除背景。进行分子量、百分比、质量、波峰等方面的定量分析。直接使用扫描仪。将数据输出到excel文件。 band leader 小巧的凝胶图像分析软件。

TotalLab 是一个全智能化的凝胶分析软件，对DNA、蛋白凝胶电泳图像、arrays, dot blots与colonies等图像可以进行很方便的处理。功能齐全，很容易上手。 Quantityone ： bio-rad公司的1d凝胶分析软件，但可配套各种产品，界面华丽，能够生成报告，具有大公司的风范。

QuantiScan 功能单一的1D凝胶分析软件，但经评测能够及其准确的测量出各个

条带的分子量。

Gel-Pro Analyzer Media Cybernetics公司的产品，一向以提供专业级的分析软件而着称。

SigmaGel SPSS公司凝胶分析产品。

Melanie 3 Viewer Swiss Institute of Bioinformatics (SI用来查看使用Melanie3软件获得的凝胶图片与相关数据，也包括一些有限的凝胶数据分析功能。 PDQuest bio-rad公司一个分析2维凝胶并生成数据库的标准软件。使用它，可以同时分析100个凝胶图像，生成包含1000个凝胶图像的数据库。 九、三维结构显示

RasMol 是计算化学与分子图形学以及信息产业的同步高速发展的成果，使一个普通的科研工作人员，在自己的个人电脑上，就可以从Internet上的各种免费数据库中，下载所需观察与研究的分子坐标文件，进而通过RasMol 以各种模式、各种角度，甚至按照自己的意愿旋转着，观察此分子神秘的微观三维立体结构，进而了解化合物分子结构和各种微观性质与宏观性质之间的定量关系。RasMol 的作者是Glaxo&Wellcome公司（世界第一大制药公司）研发中心的科学家Roger Sayle。 RasMol 最大的特点是界面简单，基本操作简单，运行非常迅速，对机器的要求较低，对小的有机分子与大分子，如蛋白质、DNA或RNA, 均能适用，且显示模式非常丰富。而且它程序短小，功能强大。尚无在功能上出其右者。其显示窗口可以很简单通过选择相应的菜单来显示分子的三维结构。用命令行窗口，通过输入命令可以执行和显示复杂和要求极高的三维图形。

CHIME IE与NetScape浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看PDB格式的文件,直接在浏览器中观看3D分子。

ICMLite 维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版,免费推出， 但功能十分强大。可读取PDB格式及其他数种格式的分子文件,易于操作,显示的分子图像我认为优于RasMol,值得一试。还可以进行一些计算操作。

POV-Ray 是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具，用在分子生物学上，便是用它生成高质量的三维大分子图像。见过Science封面上漂亮极的分子图像吗便是用它与以下软件结合制作出来的。运算POV格式文件，生成三维图形，非常棒。该软件相当于一种语言，修改pov格式文件，可以定义光源、摄像机、材质、阴影等因素，把生物分子的表面用材质填充，根据光源、摄像机得到分子三维图的一个角度的图。分辨率最大可达1280*1024。图象质量精美。 DS viewer pro Accerlys公司Discovery studio系列中的一员。

3D-mol viewer, 带动windows系统下生物软件革新的vector NTIsuite中的一员。 Cn3D 是由NCBI开发的用于观看蛋白质三维结构的软件，其设计的主要目的是为NCBI在其站点中的蛋白质结构数据库MMDB提供专业的结构观察软件，其主要的操作界面分为两个窗口，如右图所示，一个为结构窗口，另一个为序列窗口。与其他的类似的软件，如Rasmol，Weblabview等相比，其在结构观察方面主要功能上基本相似，但是图形格式上比Rasmol和Weblabview要差一些。而在与网络连接上，该软件能依托NCBI所建立的所建立的MMDB结构数据库，能直接根据输入的序列号从数据库中利用其内嵌的Entrez搜索引擎调出蛋白结构来进行观察，比其他软件要简便。而Cn3D主要的特点是能够将两个蛋白放在一起直观地进行三维结构上的比较，如下图中是将两种核酸外切酶的三维结构通过VAST对准得到的结构比较图：同样，Cn3D在结构比较方面也能利用其内嵌的Blast搜索引擎直接访问Genbank数据库找到具有局部相似性的结构数据，并在三维结构图中显示出二者具

有相似性的结构区域。

Spdbv 即Swiss-PdbViewer， 是一个界面非常友好的应用程序，使用起来比RASMOL方便，用来同时分析几个蛋白PDB文件。可以将几个蛋白叠加起来用来分析结构类似性，比较活性位点或其它有关位点。通过菜单操作与直观的图形，可以很容易获得氢键、角度、原子距离、氨基酸突变等数据。该软件与Swiss-Model服务器（蛋白立体结构构建服务器）紧密关联，可以从软件直接连到Swiss-Model服务器进行理论蛋白立体结构构建。而且，该软件可以调用POV-Ray软件（见上）生成质量非常高的蛋白图像。

Molmol 主要用来进行各种分子文件的转换，支持30种主要分子格式，也可以用来进行3维分子的简单显示。可将PDB格式输出为POV格式后，用POV-RAY进行渲染，生成非常漂亮的三维图形。演示版只支持样板文件与原子数小于20的分子文件格式的转换。不知是否有取巧的办法。 十、生物显微图像分析

Scion Image 是一个优秀的免费图像处理与分析工具。是非常流行的苹果机上的NIH（National Institutes of Health) Image的WINDOWS版，用来显示编辑分析各种图像。 读取格式为 TIFF 与BMP格式,是一个专业图像分析软件，适用与于科学处理，这点从研发单位便可看出。生物学工作者处理图像必备。

SigmaScan Pro 是一个有力的图像分析软件30天全功能演示版，进行数字图像的分析处理，可以很容易地将图像进行分析，得出科学结论。

Image-Pro Plus Version Media Cybernetics公司的专业产品，不仅可以进行显微分析，还可也进行其他科学分析。 十一、数据统计类软件

SAS世界排名第一，专业性极强，能做各种统计，是FDA唯一批准有效的统计软件。但人机对话不方便，主要是类似DOS下的命令操作，最新的版本，稍有改进，鼠标操作性较好，若今后能进一步改进操作的话，其应用将大大广泛。是专业统计人员的首选软件。

SPSS，世界排名第二，最新版本，其特点：功能强大，易于操作，简单明了，人机对话方便，数据库接口丰富，最新SPSS可以读出SAS数据，是业余人员的首选。最新版本纠正以往的不稳定、运行速度慢的缺点。运行速度是 的十倍以上，主要原因是SPSS公司将原有的内核全部更换了。但SPSS分为不同版本，如basic版、standard版和advance版。许多复杂的统计功能只在advance版中才出现，如复杂多元相关、神经网络统计，而前两版中许多复杂统计并没有（可能为了便于安装使用吧，的basic版约60M，standard约110M-150M,而高级版本则几百M。象SAS完成安装则达6张CD！因而绝大多数人不可能使用它全部功能。因而常规建议是SPSS+一个统计，一个作图，而且二者数据可以通用，效果很好！在我的主页的站点导航 statisitic：最新，运行速度最快，模块化操作，不同统计数据有不同界面风格，使用方便，目前国内有很多用户。但其知名度在前二者之下，对一般用户可以考虑选用。

Origin 是一个非常有名并且易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件，各种期刊上的统计图，几乎都是出自他的手笔。

以上的软件过于强大，下面是一些小巧易用的数据统计作图，更适合生物学的数据分析：

GraphPad Prism着名的数据处理软件,用来进行生物学统计、曲线拟合以及作图。短小而功能齐全。

SigmaPlot 2002 着名的绘图和数据分析软件包可以根据各种数据，绘制精确的两维或三维曲线，可以自由定制各数据轴的特性，并能进行数据的各种统计分析。进行一般的生物类数据处理作图，功能足以。

Simstat 一个易于使用的智能统计软件尤其适合对统计知识了解不多的人使用，它具有一个“专家系统”，引导你对数据进行统计分析。可与SigmaPlot结合生成高质量数据图。

CurveExpert ELISA标准曲线拟合、及其它各种有关的实验数 据分析，都可以应用CurveExpert进行数据分析。它使用非常方便， 可以说是实验数据处理的圣手，并且可以生成漂亮的曲线应用到论文之中。 十二、文献管理

reference Manager 可以在线通过查找关键词搜索PubMed和609个数据库中的专业资料,同时保存查找的资料为本地文件。资料内容和记录分上下两个屏幕，如有全文或想连接网络时敲键盘就可以到相应的全文文章和摘要。可以直接在WORD中查找资料，并插入引用。在文章中对引用的文献可以格式化，引用的参考资料格式有很强的用户自定义功能，可以符合各种杂志对引用格式的要求，引用时不用多窗口切换.

专业参考文献查询软件，可在线查找Ineternet上的各种文献数据库，将查找到的资料保存入本地数据库，并自动生成格式化的参考文献清单插入各种文字处理软件。

作者: cuiwk 发布日期: 2006-9-21 十三、进化树分析

Phylip 最为通用的进化树分析软件。主要包括五个方面的功能软件：i，DNA和蛋

白质序列数据的分析软件。ii，序列数据转变成距离数据后，对距离数据分析的软件。 iii，对基因频率和连续的元素分析的软件。iv，把序列的每个碱基/氨基酸独立看待（碱基/氨基酸只有0和1的状态）时，对序列进行分析的软件。v，按照DOLLO简约性算法对序列进行分析的软件。vi，绘制和修改进化树的软件。 PUZZLE 核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。根据序列数据的最大相似性构建进化树，一个软件，并且对树进行bootstrap评估。可对大量数据进行快速分析构建，程序还包含数个统计测试。

Paup 一种功能强大的商业版系统进化分析软件，据称价值一万大洋。 分子生物学软件简要功能介绍 1.三维分子类

RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构 CHIME：直接在浏览器中观看3D分子

MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件 CrystInfo：用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构 PDViewer：PDB格式文件的查看程序

Weblab Viewlite：三维分子浏览工具及大量分子文件例子 Weblab ViewerPro：三维分子浏览工具

ICMLite：三维分子浏览工具，有一些其他软件没有的功能 VMD：三维分子浏览工具，可以进行动态显示 CN3D：3D分子结构观察软件 WPDB：PDB文件检索显示分析软件

DTMM：三维分子模型显示、编辑与构建程序

Mole：高性能的大分子三维图形显示计算工具 gopenmol：显示并分析分子结构及其特性 POV-Rayv：生成三维图像工具软件

MolPOV：将PDB文件转化为POV格式文件的软件 Mol2Mol：分子文件格式转换软件

PovChem：将PDB文件转化为POV格式的文件 Ortep-3 for Windows：生成分子的热椭圆形点图 PLATON：通用结晶学软件工具

Mage：读取并演示Kinemage格式文件的专用软件 Prekin ：将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件 Swiss-Pdb Viewer：PDB文件显示与分析软件 DINAMO：蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具 PCMoleeule2 Lite：查看PDB格式文件的免费软件 StrukEd ：化学分子编辑与三维模型生成软件 JMVC：使用JAVA技术编写的三维分子查看器 ReView：读取及分析XYZ格式三维分子文件

Oscail：用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包 Moilin：分子构建与观察软件

Tinker：与Moilin配套的DOS下的分子设计建模 Biodesigner：免费的分子建模与显示软件 MoluCAD：全功能的分子建模与显示工具软件 Viewer Activex Control：三维分子显示控件

MarvinView：JAVA语言编写的化学分子二维与三维显示程序 ACD/3D Viewer for ISIS：免费的ISISDraw三维显示插件 Amira：高等三维显示建模系统

AmiraMol：Amira 相应的显示三维分子的增强工具 Visualize：分子建模和研究软件包

ScientificGL：C++OpenGLAPI三维分子开发工具

Sojourner：找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件 分析

DNAClub：DNA处理软件 JaMBW：分子生物学软件包

DNATool：功能很全面的DNA序列分析工具包

pDRAW：DNA分析与绘图软件，可绘制线性或环形DNA图 ANNHYB：用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件 RESTRICTION ANALYSIS：限制酶消化工具 ABIView：ABI格式文件显示与编辑软件 Chromas：ABI格式文件显示与编辑软件

Sequence viewer：获取与观察从GSDB获取的DNA序列数据及其关联特性的工具 DNAssist：DNA序列分析工具 DNAProbe：核苷酸序列设计工具 DnaSP：DNA序列种群遗传学分析软件 DFW：DNA分析软件

Artemis R4：以Java语言写成的序列查看工具 ’

ACT R1：以Java语言写成的序列比较查看器 GDA：主要用来进行不连续基因数据的统计分析

RDP：从一组排队比较(Align)的核酸序列中查找潜在的重组体软件

Sequencher：装配DNA小片段为大的连续序列或毗连(序列)群\"Contig\"软件 MehCalc：自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件 基因探索者：中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件 ConsInspector：DNA蛋白结合位点预测识别软件

MatInd与Matlnspector：快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具 GBuilder：JAVA语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件

GenomePixelizer：帮助理解基因组中的簇基因(C1ustermggene)之间的相互关系的软件

LabBook Genomic XML Viewer：图形化显示并处理GenBank序列数据的免费软件 Gene Construetion Kit 2 ：管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件 Genalysis：比较基因组或大量基因序列的工具软件 分析

RNAdraw：RNA二级结构分析软件 RNAstructure：预测RNA 级结构图 RnaViz：RNA二级结构图绘制程序 4.蛋白质分析

ANTHEPROT：蛋白序列分析软件包 pSAAM：蛋白序列分析软件包

VHMPT：螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件

aminoXpress：免费的多功能蛋白分析软件包 5.生化教学

：将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示出来 ：线性酶反应模拟软件 protlab：蛋白质纯化仿真软件 ：生化基础概念演示教学程序 Biochem：生化教学文件 photo：光合作用教学程序

Adrenalin：肾上腺素在肝糖原代谢中的作用演示 Virtual Cell Lab：多媒体细胞生物学教学程序 6.生化工程

：生物反应器(发酵罐)设计软件 BioStat：BioStatB发酵罐控制程序 PenSimv：青霉素发酵模拟软件 BioProSim：发酵实时模拟软件 7.序列格式转换

vised：序列输入分析和格式转换软件 ForCon：多序列文件格式转换软件 SeqVerter：序列格式转换软件

GeneStudio LE Version：序列格式显示、编辑与转换工具软件 FASTA/BLAST SCAN：FASTA与BLAST查询输出文件的处理软件 RevComp：序列格式转换软件

8.引物分析

primer Premier ：引物设计工具 Oligo：引物分析着名软件

Primer Designer：专门用 pASK-IBA～pPR-IBA表达载体免费的引物设计辅助软件 Array Designer：批量设计DNA和寡核苷酸引物工具

Beacon Designer：PCR定量分析分子信标(Molecularbeacon)设计软件 NetPrimer：基于WEB界面的引物设计程序 9.序列综合分析

pcgene：分子生物应用软件 MACAW：多序列构建与分析软件

Clustal W：用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件 Clustal X：ClustalWWindows界面程序 FASTA：数据库中查找同源序列软件 GeneDoc：对序列进行相关分析等操作

BLAST与Blastcl3：数据库中查找类似序列的软件及客户端软件 SeqPup ：生物分子序列编辑与分析软件

K-Estimator ：进化基因学研究软件，评估两条核酸序列核苷酸替代数 BioEdit：序列编辑器与分析工具软件 DAMBE：综合性序列工具软件 LaserGene：综合性序列工具软件 SeaView：图形化多序列队列编辑器

Jalview：用Java语言写的多序列队列编辑器

DNASIS：序列综合分析工具

Genamics Expression：是一个DNA与蛋白序列分析工具 Vector NTIViewer：载体查看软件 Jellyfish：多功能序列分析软件

ProSeq：核酸序列编辑与种群遗传学分析软件

Gap4 database viewer：Gap4基因装配数据库读取显示软件 SMS：DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具集合 Omiga：核酸与蛋白序列综合性分析软件 Staden：综合序列分析工具软件包

Vector NTISuite：综合性蛋白核酸分析工具包 INCA：Java脚本语言写成的BLAST服务器客户端程序

ISYS：NCGR开发的用JAVA语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台

DNA Scriptor：DNA与蛋白序列综合分析软件

Sequence Quickie-Calc：非常紧凑的分子生物学工具软件

PhyloGrapher：用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件 10.进化树分析

phylip：进化树分析软件，并可绘制进化树 TreeView：进化树处理软件

GeneTree：比较基因与种系进化树的程序 NDE：用来编辑NEXUS格式文件的程序

TreeMap：用来可视化地比较主、从进化树的程序

Spectrum：分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件 Phyltools：计算与处理进化树数据的软件

tree-puzzle：核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具 ATV：JAVA语言编写的显示\"New Hampshire\"与NHX格式的进化树文件软件 TREECON：构建和绘制进化树的软件包

ProBiosys比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件 11.质粒绘图

Plasmid Processor：绘制质粒图软件

Plasmid ProcessorPro：绘制质粒图软件，与Plasmid Processor是同一个作者 WinPlas：质粒绘图软件商业版 DMUP：环状质粒绘图软件测试版 Plasmid Toolkit：质粒绘制软件

pDRAW：DNA分析与绘图软件，可绘制线性或环形DNA图

Redasoft Visual Cloning：是有名的绘制质粒图Redasoft Plasmid 软件的升级版

SimVector：质粒图绘制软件 12.图像处理

Image Tool：科学用途的处理图像软件

Image J：用Java语言写成的科学用途的处理图像软件 Cross Checker：基因指纹图分析软件

ALFmap：ALF(Amersham Pharmacia)图像格式转换软件 Band Leader：凝胶图像处理软件

Scion lmage：图像处理与分析工具 OSIRIS：通用医学图像处理与分析软件 Melanie 3 Viewer：免费Melanie图像查看器 Smart Draw：流程图绘制软件演示版 GIMPWin：图像处理自由软件

ChromoZoom：比较两个图像的相同与不同之处软件 bandscan：蛋白凝胶电泳图像分析软件

SigmaScanPro：图像分析软件30天全功能演示版 SigmaGel：凝胶图像分析软件 TotalLab：图像分析软件 Lablmage：凝胶图像分析软件

GelDiff：定量比较两个2D凝胶图像的不同之处的JAVA软件 Timediff：分析蛋白/基因表达图谱时间序列的JAVA软件 QuantiScan：使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件 PDQuest：分析2维凝胶并生成数据库的标准软件 13.数据处理

CurveExpert：用于ELISA标准曲线拟合的软件 Cliekh Graph：实验数据作图软件 Statistica：专业统计软件

GraphPad PRISM：着名的数据处理软件 NoSA：中文非典型数据统计分析系统 CrossGraphs：多变量数据库图形显示软件

SigmaPlot：绘图和数据分析软件包30天全功能评估版 SYSTAT：数据统计分析与作图的利器30天全功能演示版 SigmaStat：智能统计软件30天全功能演示版 PeakFit：自动分离、拟合与分析非线性数据软件 TableCurve：自动两维曲线拟合与经验公式查找软件 TableCurve ：自动三维曲面拟合与经验公式查找软件

SPSS：非常权威且有名的数据统计处理软件30天全功能演示版 Origin：易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件 DATb：进行生物曲线拟合与数据分析的免费软件

数据作图助手：对实验结果进行数据分析和作图的专业软件 14.检索与阅读

PatentIn：用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件 Checker：用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件 ：中国生物学文献数据库检索客户端软件 PathDB检索程序：(代谢途径数据库)检索程序

PubCrawler：Medline文献库与GenBank核酸序列库检索软件 NetRoseBrowser：PDG格式浏览器

Book Express：专门用于超星数字图书下载的工具软件 EndNote：专业参考文献查询软件

Reference Manager：专业参考文献查询软件 Procite：参考资料检索管理软件

Sequin：数据库GenBank，EMBL，DDBJ查询软件

MiniViewer：数图阅览器

Compresslt：JBG(NLC)”JPG转换功能软件 Refs：参考文献管理软件

Scholars Aid：文献参考资料等日常资料的整理软件 paperworks：免费的参考文献管理软件 KD：知识仓库建库管理系统 15.基因芯片

AMADA：用来组织、研究、显示、分析微数组(Microarray)数据软件 ScanAlyze：进行微矩阵荧光图像分析软件

Cluster：对大量微矩阵数据组进行分析处理的软件 TreeView：用图形来显示Cluster软件分析的结果软件 AMAD：微数组数据库

ArrayMakerv：Stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档

J-Express：分析微矩阵(Microarray)实验获得的基因表达数据的软件 16.其他功能软件

digitizer：图形数字化软件，可以将曲线图转化为数据与等式 Graph Paper：坐标纸打印软件

DynaFit：酶动力学数据或配体—受体结合数据处理软件 Migrate：从遗传学角度，估算人口移民率程序 arlequin：人口遗传学软件

正交设计助手：正交实验设计辅助工具软件

FBAT：家族遗传相联检验的统计程序 GGT32：图形化基因型表示软件

CERVUS：使用共显性标记数据推断亲缘关系的软件 Jarnac：代谢过程模拟软件包

Gepasi：化学与生物化学反应动力学仿真与优化软件 BCT：微生物趋向性模拟程序

StochSim：随机生物化学反应模拟软件 Bio_MW：生物化学分子量计算软件

MatchCode：将蛋白和核酸序列进行简单匹配和格式化输出的中文软件 Map Manager：回交、杂交与重组自交系分析遗传作图实验结果的软件 MolEco：以遗传学方法评估杂乱交配频率的软件 Canvas：绘图软件

免疫室管理系统：中文免疫室综合软件 Cyrillic：家谱绘图软件

Frozen Cell Stock Monitor：用来管理储存在液氮容器中的生物样品(例如细胞系、血清等等)的程序

MICE：虚拟动物饲养设施，用来帮助管理饲养设施中的实验动物软件 DBsolve：代谢及酶—受体结合模拟软件 boxit：管理生物样品的数据库系统

GRR：检测系谱误差(pedigreeerrors)的应用软件 健康药霸：药典类的软件 AceDB：基因组数据库软件

MAPL98、DIAL98与GEST98：El本学者编制的几个统计基因学(StatisticalGenetics)软件 PED：系谱(Pedigree)绘制软件 PEDRAW：系谱(Pedigree)绘制软件

quantiRT：内置宏程序，用来辅助定量RT-PCR实验的Excel文件 BateView：管理与追踪小型的实验鼠生殖群体的Excel文件

MassXpert：帮助科学家预测与分析从蛋白组学研究中获得的蛋白质质谱数据的软件

MestRe-C与MestRe-CnD：分析、显示与仿真1D与2D磁共振图谱的软件 ACD/SpecViewer：免费光谱数据显示软件

ACD/CNMR Viewer：ACD/HNMR用来显示ACD/NMR Predictors预测的所绘化学结构式

Viewer：磁共振图谱文件的免费软件

WinMDIver：分析流式细胞仪数据文件的免费软件

TestDNA：根据已知成分值生成细胞周期FCS文件的免费工具软件 Cylchred：细胞周期分析(CELLCYCLEANALYSIS)软件

gX-Path Vision：生成、编辑与显示生物代谢途径的工具软件 生物五笔：生物医学专业输入法 17.化学绘图

ACD/CHEMSKETCH：绘制分子结构的免费软件及其汉化版

ACD/ChemSketch及ChemBasic：绘制分子结构的免费软件版本及其汉化版 Chemfont：化学符号与TureType字体，可以在Word中直接插入文章中

：化学图片集，含有近400幅与化学有关的GIF图片 ISIS DRAW：绘制化学结构式的免费软件

AutoNom：ISIS／Draw软件的插件(自动生成符合IUPAC命名规则的化合物名称) ChemWindows：绘制化学结构式的免费软件

MarvinSketch：JAVA语言编写的小巧好用的化学结构式绘制程序 ACD/Structure Drawing Applet：绘制化学结构式免费JAVA小程序 ChemPen：绘制化学结构式软件 ChemPen+：绘制化学结构式软件 ChemPen：绘制化学结构式软件 18.化学应用 ：分子量计算器 ：化学方程式配平软件 ：化学试剂制备计算器 ：有机化学命名练习程序

：Windows95下的免费化学方程式配平程序 ：小巧的元素周期表 ：高级元素周期表 CAF：计算机辅助配方软件 CFT：化学式教师

元素屋：查询112种元素的各个信息的中文软件

化学反应方程式编辑器：制作化学反应方程式、离子方程式、分子式、离子式等 CRS：化学反应方程式配平器

Model ChemLabv：化学实验教育软件及其汉化版 ：免费的元素周期表

化学品电子手册：一个综合性的化学品手册 19.在线综合工具

Biology Workbench：基于WEB的生物学综合工具 sewer：网上常用在线工具集合，本地版 20.在线蛋白工具

BCM Search Launcher：蛋白序列二级结构预测综合站点 DAS：蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列，预测跨膜区域 TopPred：蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测在线工具 SOSUI：膜蛋白分类和二级结构预测在线工具

PSIpred-MEMSAT：进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测 HMMTOP：预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结构服务器

SMART：提供蛋白序列，在结构域数据库中查询/显示出其结构域及跨膜区等 TMpred：预测蛋白序列跨膜区 TMHMM：预测蛋白的跨膜螺旋

The PredictProtein server：提供蛋白数据库查询，预测蛋白各种结构的服务 SPLIT：膜蛋白二级结构预测服务器

PRED-TMR：提供基于SwissProt数据库统计分析的预测蛋白跨膜片段的服务 CoPreThi：基于INTERNET的JAVA程序，预测蛋白的跨膜区 TMAP：提供预测蛋白跨膜片段的服务 analysis

Pattern Search and Discovery：巴斯德研究所提供的常用RNA在线分析工具 DNA sequence analysis：巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具

Search Genes and Coding Regions：巴斯德研究所提供的常用DNA在线分析工具 Oligonucleotide Calculator：巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具 解链温度计算器：JAVA语言写的寡核苷酸计算器，给出核酸序列，计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。可以下载后使用，当小计算器

BCMgene-finder：核酸序列查找服务器，提交核酸序列，选择相应的数据库，进行序列查找 22.在线引物设计

The Primer Generator：在线引物设计程序 Prime3：比较有名的在线引物设计程序 到论坛中讨论 >> 常用核酸和氨基酸代码

发布日期:2006-7-21 热门指数:766 常用核酸和氨基酸代码 Amino Acids Table

Here is a list of the standard one-letter amino acid codes and their three-letter equivalents. The synonymous codons and their depiction in the IUB codes are shown. You should recognize that the codons following semicolons ( are not sufficiently specific to define a single amino acid even though they represent the best possible backtranslation into the IUB codes!

Symbol 3-letter Code Amino-acid Codons A Ala Alanine GCT,GCC,GCA,GCG

B Asp,Asn Aspartic, Asparagine GAT,GAC,AAT,AAC C Cys Cysteine TGT,TGC D Asp Aspartic GAT,GAC E Glu Glutamic GAA,GAG F Phe Phenylalanine TTT,TTC G Gly Glycine GGT,GGC,GGA,GGG H His Histidine CAT,CAC I Ile Isoleucine ATT,ATC,ATA K Lys Lysine AAA,AAG

L Leu Leucine TTG,TTA,CTT,CTC,CTA,CTG M Met Methionine ATG N Asn Asparagine AAT,AAC P Pro Proline CCT,CCC,CCA,CCG Q Gln Glutamine CAA,CAG

R Arg Arginine CGT,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG S Ser Serine TCT,TCC,TCA,TCG,AGT,AGC T Thr Threonine ACT,ACC,ACA,ACG V Val Valine GTT,GTC,GTA,GTG W Trp Tryptophan TGG X Xxx Unknown

Y Tyr Tyrosine TAT,TAC

Z Glu,Gln Glutamic, Glutamine GAA,GAG,CAA,CAG * End Terminator TAA,TAG,TGA Standard Genetic Code U C A G U UUU Phe F UUC Phe F UUA Leu L UUG Leu L UCU Ser S UCC Ser S UCA Ser S

UCG Ser S UAU Tyr Y UAC Tyr Y UAA Stop UAG Stop UGU Cys C UGC Cys C UGA Stop UGG Trp W C

CUU Leu L

CUC Leu L CUA Leu L CUG Leu L CCU Pro P CCC Pro P CCA Pro P CCG Pro P CAU His H CAC His H CAA Gln Q CAG Gln Q CGU Arg R CGC Arg R CGA Arg R CGG Arg R A

AUU Ile I AUC Ile I AUA Ile I AUG Met M ACU Thr T ACC Thr T

ACA Thr T ACG Thr T AAU Asn N AAC Asn N AAA Lys K AAG Lys K AGU Ser S AGC Ser S AGA Arg R AGG Arg R G

GUU Val V GUC Val V GUA Val V GUG Val V GCU ALA A GCC ALA A GCA ALA A GCG ALA A GAU Asp D GAC Asp D GAA Glu E

GAG Glu E GGU Gly G GGC Gly G GGA Gly G GGG Gly G

Genome Size and DNA Content Genome Size

(base pairs x 109) Coding DNA (%) Bacterium (E. coli) 100 Yeast (Saccharomyces) 70 Nematode (Caenorhabditis) 25 Fruitfly (Drosophila) 33 Newt (Triturus) - Human 9 - 27

Lungfish (Protopterus) - Flowering plant (Arabidopsis) 31 Flowering plant (Fritillaria)

Cavalier-Smith, T. (ed.) The Evolution of Genome size (Wiley, Chichester, 1985). Nucleotides

The meaning of each symbol (GCG files), its complement, and the Staden file equivalents are shown below.

IUB/GCG Meaning Complement A A T C C G G G C T / U T A M A or C K R A or G Y W A or T W S C or G S Y C or T R K G or T M V A or C or G B H A or C or T D D A or G or T H B C or G or T V X / N G or A or T or C not G or A or T or C X 国际单位换算表

发布日期:2006-6-13 热门指数:1554 重量换算

7. 重量换算 (一)

公 制 英 制 美 制 中国市制英 制港 制公 制 中国市制

英美制

公 吨 长 吨 短 吨 担 英 担 司马担 公 斤 斤 磅

(Metric (Long (Short (Hundred Kilo-

ton) ton) ton) weight) (Picul) gram) (Pound)

1 20 1,000 2,000 2, 1 20 1, 2, 2,240 1 15 1, 2,000 1 50 100 1 112 1

1 2 1 1 8. 重量换算 (二)

公 制 英 美 制 常 衡 英 美 制 金 衡 或 药 衡 中 国 市 制

公 斤 克(公分) 磅 两(盎司) 磅 两(盎司) 两

(Kilo- (pound) (Ounce) gram) (Gram) (Pound) (Ounce) (Troy or A pothecary)

(十量制)

1 1,000 20 1 1 16 1

50 1 ________________________________________ 单位长度重量换算 9. 单位长度重量换算

公 制 英 美 制 制

公斤/米 磅/尺 磅/寸 (Kilogram/Meter) (Pound/Foot) (Pound/Inch) 1 1 12 1 1

________________________________________ 单位面积换算 10. 单位面积换算

公 制 英 美 中 国斤/尺 制 中市国

市 制

公斤/公顷 英担/亩 磅/亩 斤/亩

(Kilogram/Hectare) (Hundred-weight/Acre) (Pound/Acre) 1 1 112 1 1 ________________________________________ 密度换算

11. 密度换算 (一)

公 制 英 美 制 中市 制

公斤/公升(公吨/立方米) 磅/立方尺 磅/立方寸 立方尺

(Kilogram/Litre) (Pound/Cubic foot) (Pound/Cubic inch) 1 1 1,728 1 2, 1 12. 密度换算 (二)

公 制 英 美 制 中国斤/国

市 制

克/公升 量/(英)加仑 量/(美)加仑 两/升

(Gram/Litre) (Ounce/Imperial gallon) (Ounce/US gallon) 1 1 1 50 1 ________________________________________ 摄氏和华氏温度换算 13. 摄氏和华氏温度换算

华氏 'F (Fahrenheit)= ℃ X 9/5+32

摄氏 ℃ (Celsius or Centigrade)= 9/5X('F-32) 压力换算 32. 压力换算

/平方厘米; 1 大气压 = 在摄氏零度时为 760 水银柱(毫米); 1 大气压 = 在华氏 62 度 时的比重 =

公斤/平方(厘米) 水柱(米) 水银柱(毫米) 大气压 水柱(寸) 水银柱(寸) 磅/平方寸

[Kg/cm2(at)] (m H2O) (mm Hg) (atm) (in H2O) (in Hg) in) 1 10

1 1

760 1 30 1 1 1 ________________________________________ 功和能换算 33. 功和能换算

公斤-米 焦 尔 千瓦-小时 千 卡 尺-磅 英马力-小时 英热单位

(Kilogram- (Joule) (Kilowatt- (Kilocal- (Foot- (Horse- (British

meter) hour) orie) pound) power-hour) Thermal-Unit

1 1

367,100 3,600,000 1 2,655,200 3, 4, 1 3,088 1

273,750 2,684,500 1,980,000 1 2, 1, 1

千瓦(Kilowatt),电的功率单位. 1 千瓦 = 1,000 瓦特 (Watt) = 1 焦尔(Joule)/秒

(Second).焦尔为 1 牛顿力使物体移动 1 米的功.使质量位 1 公斤的物体得到每秒 1 米

加速度之力,叫做 1 牛顿(Newton).1 千瓦小时(Kilowatt-hour)即 1 度(电). 马力(Horsepower-HP)功率单位. 分英美制和公制.英美制 1 马力等于在 1 秒钟之内

把 550 磅重的物体提高 1 英尺 ( = 每秒 76 公斤-米)所做的功; 公制 1 马力 为在 1

秒钟内把重 75 公斤的物体提高 1 米所做的功. 1 英美制马力 = 公制马力 1 BTU (British Thermal Unit,英制热量单位),为在最大密度的温度下,使 1 磅水的

温度升高 1 `F 时所需的热量.公制热量单位为卡路里(Calorie),简称卡. 1 卡为在 1 个

大气压力下,使 1 克水的温度从 15`℃升至 16`C 时所需的热量. 1 千卡(Kilocalorie or

Kilogram calorie) = 1,000 卡.\"撒姆\"(Therm),为英煤气销售使用的热量单位. 1 撒姆

= 100,000 英热单位(BTU)