法律分析：1、不同的功能：林业证书的功能是确认所有权或使用权，权利人依法持有森林权属证书，在森林权属证书范围内拥有森林，林木和林地的所有权或使用权。
2、术语不同：林业证书是该证书的旧版本，林业证书是否仍然有效，取决于发放山林证书时商定的使用期限，从2000年4月18日开始，将使用全国统一的林权证样式和序列号。
3、签发机构不同：林业证书由其所属的林场签发，森林使用权证书由县级以上地方人民政府盖章生效国务院确定的属于国家所有重点林区的森林，树木，林地，由国务院林业行政主管部门盖章生效。
法律依据：《林木和林地权属登记管理办法》
第二条 县级以上林业主管部门依法履行林权登记职责。林权登记包括初始、变更和注销登记。
第三条 林权权利人是指森林、林木和林地的所有权或者使用权的拥有者。
第四条 林权权利人为个人的，由本人或者其法定代理人、委托的代理人提出林权登记申请；林权权利人为法人或者其他组织的，由其法定代表人、负责人或者委托的代理人提出林权登记申请。
第五条 林权权利人应当根据森林法及其实施条例的规定提出登记申请，并提交以下文件：(一)林权登记申请表；(二)个人身份证明、法人或者其他组织的资格证明、法定代表人或者负责人的身份证明、法定代理人或者委托代理人的身份证明和载明委托事项和委托权限的委托书；(三)申请登记的森林、林木和林地权属证明文件；(四)省、自治区、直辖市人民政府林业主管部门规定要求提交的其他有关文件。
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